statsape Q&A-第6页

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转换多变量标签编码：invalid syntax (<string><string>, line 1)</string>-决策链社区论坛

转换多变量标签编码：invalid syntax (<string>, line 1)

报错原因：（1）通常为条件未指定变量（逻辑符号或者运算符号前面缺少变量），此处应该为x1<=20 and x1>=3 如下图在*号前面没有变量，没有x1**x2的写法，必须是x1*x2*x3这种

# 转换多变量标签编码

空鱼O1个月前

05910

SHAP：Model type not yet supported by TreeExplainer:

错误原因：shap分析不支持KNN模型

# SHAP分析

空鱼O1个月前

0596

批量去除连锁不平衡：Error in file(file, “rt”): cannot open the connection

报错原因：plink分析SNP关联的结果无法写出到计算机，可能的原因有很多，以下为常见原因（1）plink的版本与计算机不兼容，在windows系统中分为32位和64位（2）plink的写出权限不足（与计算机有...

# 连锁不平衡

空鱼O23天前

05814

多因素竞争风险模型：Error in cmprsk::crr(WD[, var timel, WD[, var status], WD[, var treatment]):NA/NaN/nf in foreign function call (arg 4)

报错原因：所选择的时间，状态，分组变量的值中可能存在空值或者inf值解决方法：检查变量空值或者inf值，去除或者插补，参考方法https://bbs.statsape.com/tips/534.htmlhttps://bbs.statsape.c...

# 多因素竞争风险模型

空鱼O1个月前

0585

Error in spread(., key = “.group.”, value = dv) :ℹ Keys are shared for 98 rows

【报错原因】数据不是重复测量数据（time出现几次，id就要出现几次）【解决方法】更换正确的重复测量数据

# 重复测量方差分析

里里里里卡421个月前

05812

分类预测：‘DecisionTreeRegressor’ object has no attribute ‘predict proba’

错误原因：回归模型不能使用分类预测解决方法：把分类预测节点改成回归预测节点

# 分类预测

空鱼O1个月前

0586

Error in binom.test(sum(mydata1[, var_input[i]] < mydata2[, var_input[i]]), :'n'必需是大于等于'x'的正整数

【报错原因】变量存在空值【解决方法】插补空值或者删除空值

# 符号检验

里里里里卡421个月前

05710

分析单元“20.平衡权重计算”运算出错，请检查。Error in wt[z == i] <- allwt[z == i, i] :NAs are not allowed in subscripted assignments请检查表格变量类型是否符需要转换，变量值是否需要插补空值，变量名是否存在非法字符！

【报错原因】变量存在NA值【解决方法】删除空值或者插补空值

# 平衡权重计算

里里里里卡421个月前

0576

朴素贝叶斯：Negative values in data passed to MultinomialNB

报错原因：训练集的特征变量中存在负数，这对于贝叶斯的MultinomialNB的方法是不允许的解决方法：去除训练集特征变量中的负数

# 朴素贝叶斯

空鱼O12天前

05712

Error in geese.fit(xx, yy, id, offset, soffset, w, waves = waves, zsca, :nrow(zsca) and length(y) not match

【报错原因】选择变量里含有空缺值【解决方法】建议将变量的空缺值进行插补

# 广义估计方程

里里里里卡421个月前

05710

正类问题：Assertion on ‘positive’ failed

机器学习SE模块的正类参数涉及到的模块包括数据任务器SE，机器学习绘图SE，机器学习多模型绘图SE。设置正类的原因是，对于二分类模型，确定目标变量的正类，这些影响混淆矩阵相关的指标和ROC/A...

# 机器学习SE # ROC # AUC

Divine16天前

05711

Error in glmnet(x, y, family = “binomial”, alpha = 1, nlambda = lambda_values) :x has missing values; consider using makeX() to impute them

【报错原因】选择变量里含有空缺值【解决方法】建议将变量的空缺值进行插补

# Ridge回归

里里里里卡421个月前

05614

Error in glmnet(x, y, family = “gaussian”, alpha = 1, nlambda = lambda_values) :x should be a matrix with 2 or more columns

【报错原因】自变量只选择一个，需要2个以上【解决方法】选择二个以上的自变量

# Ridge回归

里里里里卡421个月前

0565

计算时间间隔：time data “2020-10-20” doesn’t match format “%Y-%m-%d %H:%M:%S”, at position 4. You might want to try:

错误原因：日期格式不匹配，如下图所示，待计算的两个日期变量的值，存在格式为Year-Month-Day H:M:S的行，则计算时间间隔的时候，必须选择Year-Month-Day H:M:S的格式解决方法：如下图所示，修...

# 计算时间间隔

空鱼O1个月前

05610

Error in profile.glm(object, which = parm, alpha = (1 – level)/4, trace = trace) : profiling has found a better solution, so original fit had not converged

【报错原因】选择的因变量和自变量不适合此分布类型【解决方法】更换因变量/自变量或分布类型

# 自动流行病学分析

里里里里卡421个月前

0565

孟德尔随机化本地数据：Error in h(simpleError(msg, call)):◆◆’seqinfo”◆◆◆◆◆◆h◆◆◆◆’x”◆◆◆◆@◆◆.:no ‘header’ line “#CHROM POS ID..”?

报错原因：输入的GWAS遗传变异位点数据表格式非法，ieu数据库中收录的GWAS数据集很多存在这个问题，而且经常更新解决方案：（1）ieu官网重新下载目标编号的GWAS数据集（2）更换别的GWAS数据集

# 孟德尔随机化

空鱼O1个月前

05614

该组数据无法绘制统计表

【报错原因】自变量太多【解决方法】减少自变量

# KM生存曲线

里里里里卡421个月前

0565

Error in quantile.default(WD[, var_independent[i]], probs = numeric_vector) :’na.rm’如果设为FALSE的话不允许有遺漏值和NaN

【报错原因】变量存在空值

# 分位数节点

里里里里卡421个月前

05613

生存分析ROC图：Error in roc.default(response, predictors[, 1], …) : ‘response’ must have two levels

报错原因：（1）输入的因变量不是0，1二分类的值（2）在多因素生存分析中，如果以上的情况不存在，则可能是生存时间中位数以下的样本的生存状态不是0，1二分类变量解决方法：检查因变量是否...

空鱼O36天前

05614

Error in imputeTS::na_ma(v, k = k, weighting = “linear”) :At least 2 non-NA data points required in the time series to apply na_ma.

【报错原因】 ID id筛选之后数据没了【解决方法】更换数据或变量

# 时间序列插补

里里里里卡421个月前

0557

$Error in nlmr::fracpoly_mr(y, x, g, covar = cov_data, family = family_type, :fractional polynomial models require the exposure to be >>1。-决策链社区论坛$

Error in nlmr::fracpoly_mr(y, x, g, covar = cov_data, family = family_type, :fractional polynomial models require the exposure to be >>1。

【解决方法】通过公式计算出来的beta不可以是负数

# 非线性孟德尔随机化

里里里里卡421个月前

05515

矩阵相关分析：Error in rcorr(mat one,mat two,type = method test): must have >4 observations。

报错原因：样本太少，样本数最少5以上解决方法：增加样本数

# 相关分析

空鱼O34天前

0558

聚类热图：only defined on a data frame with all numeric-alike variables

报错原因：选择分析的变量中存在个别非数值变量解决方法：删除这些非数值的变量

# 聚类热图

空鱼O1个月前

0555

Error: Cochran-Armitage test for trend must be used with rx2-table

【报错原因】选择变量出现问题，不是二分类【解决方法】需要确保数据是一个两列的列联表，分别代表二分类响应

# 趋势卡方检验

里里里里卡421个月前

0558

Error in geem(as.formula(fml), id = WD[, var_id], corstr = “unstructured”, :Cannot estimate that many parameters: not enough subjects for unstructured correlation

【报错原因】结构问题

# 广义估计方程

里里里里卡421个月前

05512

Error in onestrat(x[index, , drop = FALSE], clusters[index], nPSU[index][1], :Stratum (51) has only one PSU at stage 1

【报错原因】分层变量和自变量不适配，只有一个数据在某个分层里【解决方法】重新选择适合变量

# 调查设计加权嵌套-回归分析

里里里里卡421个月前

05513

Error in Summary.factor(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L,:sum’ not meaningful for factors

【报错原因】考虑有个别PSU分层数量太少【解决方法】使用强制分层运算的选项

# 调查设计卡方检验

里里里里卡4233天前

05513

转换多变量标签编码：invalid syntax. Perhaps you forgot a comma? (<string>, line 1)-决策链社区论坛

转换多变量标签编码：invalid syntax. Perhaps you forgot a comma? (, line 1)

报错原因：通常为逻辑连接符未加空格，此处应该写为x1<=20 and x2>=3

# 转换多变量标签编码

空鱼O1个月前

0558

Error in (function (classes, fdef mtable):unable to find an inherited method for function ‘mcols’ for siqnature “”NULL”

【报错原因】暴露相关突变位点筛选结果为空【解决方法】尝试更换Pvalue阈值

# 孟德尔随机化本地数据

里里里里卡421个月前

05512

Error in dplyr:mutate(, z = (first.m – last.m)/sgrtl(firstv + lastwy): Caused by error! object “first.m’ notfound.模块”贝叶斯Meta分析Geweke诊断图”在输出结果数据时有警告信息:Error in doirmutatel, z= (frstm – astmysartlfrsty t asty); Caused by eror

【解决方法】重启后重新运行

# 贝叶斯Meta分析Geweke诊断图

里里里里卡421个月前

0555

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